人体最复杂的微生态系统--肠道微生态系统
人体的微生态系统主要有五部分组成，包括口腔、呼吸道、胃肠道、皮肤和泌尿生殖系统，其中以肠道微生态系统最为重要和最为复杂。人体的微生态菌群种类多达余种，肠道常驻菌群接近种，99%是以双歧杆菌和类杆菌为主的专性厌氧菌，1%是以乳酸杆菌为代表的兼性厌氧菌。肠道内菌群的重量约克，相当于肝脏的重量。
肠道菌群有着非常广泛的生理功能，它可以发挥生物拮抗作用、保存生物化学屏障、胃肠道免疫屏障的完整性、促进营养物质的吸收、维持内环境稳态和抗癌作用。整体看来可促进微生态平衡及保护宿主健康的生态作用。机体健康情况下肠道菌群是平衡的，但当这一平衡状态被打破时，疾病会接踵而至。
肠道微生态系统与免疫的关系
肠道菌群与免疫系统有着非常密切的关系。首先肠道粘膜免疫系统是固有免疫的重要组成部分，它促进营养物质的吸收和防御感染和抑制微生物穿透组织屏障；其次肠道菌群可对免疫系统产生重要的影响，表现在肠道菌群可影响肠壁粘液层的特性、肠道菌群可诱导肠壁淋巴样结构的发育、道菌群可调节免疫细胞的分化以及肠道菌群可影响炎性介质的产生。
肠道微生态系统与类风湿关节炎的关系
类风湿关节炎是一种多因素导致的疾病，遗传、环境、性别及年龄等均是疾病发生的危险因素，而这些危险因素同时也影响着肠道菌群的组成，所以肠道菌群将这些危险因素连接在了一起。肠道菌群参与类风湿关节炎发病的说法不是一个新话题，早在20世纪出就有风湿病血者提出类风湿的*血症因子假说，指出革兰氏阴性菌的大量繁殖产生的*性代谢产物可分泌入血进而诱发关节炎。有些风湿病学家也在很早以前就开始应用以肠道菌群-关节轴为靶向的类风湿关节炎治疗方案，比如现在正在使用的柳氮磺吡啶和米诺环素，都属于慢作用抗风湿药。
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